Рассмотрим к примеру документ Реализация товаров и услуг. В этом документе есть договор с контрагентом и есть строки с номенклатурами. В договоре есть поле Группа финансового учета расчета. Для группы можно настроить счета учета долгов и авансов. Именно по этим счетам будут формироваться проводки по взаиморасчетам при проведении документа.
В элементах номенклатуры есть поле Группа финансового учета номенклатуры. Тип этого поля - справочник с одноименным названием. Для ГФУ номенклатуры нужно заполнять счета учета на складе, переданных на комиссию товаров и т.д. Именно по этим счетам учета будут создаваться движения при проведении документов для каждой номенклатуры. То есть в номенклатуре есть ссылка на ГФУ. Для ГФУ настроены счета учета. По этим настроенным счетам и создаются проводки.
В старых программах 1С УПП / КА 1.1 признак отражения документа в управленческом, налоговом и бухгалтерском учете находился прямо в шапке документа и выглядел в виде флажка. В КА 2 / ERP это реализовано по-другому. Если нужно отразить документ только по упр. учету, нужно выбрать в нем организацию "Управленческая организация". По умолчанию она отключена, ее использование включить нужно в настройках.
Если нужно документ отразить только в бухгалтерском и налоговом учете, а в упр. учете не надо отражать, необходимо выбрать в документе "Реализация товаров и услуг" операцию "Реализация клиенту регл. учет".